Есть некоторые данные по Манасу, например в "Маджму ат-Таварих" его дедом назван Каркара-хан, а его народ "каркаринскими кыпчаками". Одноименная область, где кимаки схожи по обычаям с кыргызами, была в Кимакском каганате. В Чингистау есть местности связанные с Манасом, перевал, каменные ясли его коня Ак-кула. По эпосу Бокмурун проводил поминки своего отца Кокетая в районе Черного Иртыша. Стоит отметить также, что времена Мухаммеда-кыргыза и Султан-Саид-хана кыргызы уже полностью сформированный этнос, это условно конец 15 - начало 16 веков. Есть некоторые нюансы по связям кыргызов с моголами, например генеалогия правого крыла кыргызов почти тождественная генеалогии могольского Инга Тюра, также вспомните, что кыргызов именовали моголами, но с другой стороны отделяли их.
По культуре не думаю, что условно "дешт-и кыпчакская" культура, узоры, юрты, одежда, обычаи, термины родства, кулинария, и т.д. это результат союза с казахами. Этот союз начался с Тахира, в то время кыргызы уже заняли нынешние земли Тянь-Шаня.